主人公、辻村なごみ（名前変更可）は私立高校に通う２年生。
入学式の日に桜並木で出会った「桜の君」が忘れられず、
なんとなく探してしまう毎日を送っている他は、
いたって普通の学生です。

そんな中、放課後に行われる特別講座の案内を聞いたなごみ。
「花と神話」という珍しいテーマに惹かれ、
親友の美郷と共に講座に参加することを決めます。

そして迎えた当日。
なごみは探し続けていた「桜の君」と再会するのですが――